丝瓜留种田需要500～1000米的隔离区。一般生产者选留丝瓜种子，株选效果很好。选留种子时，选择具有本品种性的植株。一般要求节间短、节间均匀、叶片大小适中、叶柄短、结瓜早、丝瓜条上下粗细均匀的植株留作种株，在中期人工受粉后套袋，防止杂交。套袋的方法：在雌花开放时，用自花的雄蕊对花后，套上小纸袋，花冠萎缩后就可去掉，把种瓜作好记号，不要误采。一般每株可留种瓜3～4条。
瓜种采收时间最好在植株自然枯死后采瓜剖种，种子晒干后收藏。采种后的丝瓜络可以入药，也可做厨房清洁抹布，或送去专业加工工厂生产防汗鞋垫的夹层，经济收入也比较可观。